在审
基于拷贝数变异(CNV)检测内蒙古绒山羊早期生长性状相关基因的方法
摘要
本发明提供一种基于拷贝数变异(CNV)检测内蒙古绒山羊早期生长性状相关基因的方法。该方法包括:获取461只内蒙古绒山羊的全基因组重测序数据;利用CNVnator软件检测常染色体CNV,筛选出26,003个非冗余CNV,覆盖常染色体基因组的1,015.4Mb(38.97%);基于CNV进行GWAS分析,鉴定出11个与早期生长性状(出生体重CSZ、断乳体重DRZ、断乳前日增重ADG及12月龄体重ZWT)显著相关的CNV,其中2个CNV同时影响ADG和DRZ;通过生物信息学分析鉴定出7个关键候选基因(<I>ZN845</I>、<I>SOX15</I>、<I>FGF11</I>、<I>GPS2</I>、<I>DVL2</I>、<I>SPRY4</I>及<I>STAT2</I>),并利用GO和KEGG功能富集分析发现其参与细胞增殖、分化及蛋白质磷酸化等生物学途径。本发明为内蒙古绒山羊分子标记辅助育种提供了理论依据,具有重要的科学价值和应用前景。
暂无引用专利



