一种棉花Indel标记及其在棉花育种中的应用

1.一种棉花Indel标记FP_D03_Indel，其特征在于，含有所述棉花Indel标记FP_D03_Indel的核苷酸序列如SEQ ID NO.1或SEQ ID NO.2所示。 2.权利要求1所述的棉花Indel标记FP_D03_Indel在如下一项或多项中的应用：1)棉花早花育种；2)区分棉花开花期；3)鉴定棉花开花期。 3.一种鉴定棉花开花期的方法，其特征在于，包括如下步骤：以SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.4所示的引物对对待测棉花样本的基因组DNA进行PCR扩增，得到扩增产物；将所述扩增产物进行测序，得到扩增产物序列；当所述扩增产物序列如SEQ ID NO.1所示时，则所述待测棉花样本的基因型为纯合型FP_D03，所述待测棉花样本开花晚且吐絮晚；当所述扩增产物序列如SEQ ID NO.2所示时，则所述待测棉花样本的基因型为纯合型fp_D03，所述待测棉花样本开花早且吐絮早；当所述扩增产物序列如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示时，则所述待测样本棉花的基因型为杂合型FP_D03/fp_D03，所述待测样本的开花期和吐絮期介入基因型为FP_D03和fp_D03的棉花品种之间。 4.根据权利要求3所述的方法，其特征在于，所述PCR扩增的体系包括：超纯水4.7μL，基因组DNA 1.0μL，10×Buffer 1.0μL，2.5mM的MgCl 2 1.0μL，10mM的dNTPs 0.2μL，10μM的正向引物1.0μL，反向引物1.0μL，TaqDNA聚合酶0.1μL。 5.根据权利要求3或4所述的方法，其特征在于，所述PCR扩增的程序包括：95℃预热5min；94℃变性45s，55℃退火45s，72℃延伸1min，循环30次；72℃延伸10min；4℃保存。