有效

一种基于肠道微生物信息预测犊牛腹泻抗性的方法

王佳堃、陈宏伟、杨斌、黄开朗、柳娅璐
浙江大学

摘要

本发明提供一种基于肠道微生物信息预测犊牛腹泻抗性的方法,具体包括以下步骤:采集可提取微生物群DNA的犊牛粪便样品;检测犊牛粪便样品中微生物群各微生物的存在和丰度,计算微生物群的互作强度指数以及不同组别的总丰度;根据检测信息和计算信息构建随机森林机器学习模型;根据受试犊牛粪便样品中微生物群的互作强度指数、不同组别的总丰度和随机森林机器学习模型预测受试犊牛腹泻抗性。本发明可以有效预测犊牛对腹泻的抗性,具有较高的准确度、灵敏度和特异性,采用本发明的方法在初生后利用粪便微生物评估犊牛的腹泻抗性,有助于犊牛群体选育,减少抗生素预防和治疗腹泻带来的负面作用。