有效
菌株基因组测序信息查询方法、装置、电子设备及介质
史文聿、范国梅、孙清岚、吴林寰、马俊才
中国科学院微生物研究所
史
史文聿机构 暂无
技术领域 暂无
范
范国梅机构 暂无
技术领域 暂无
孙
孙清岚机构 暂无
技术领域 暂无
吴
吴林寰机构 暂无
技术领域 暂无
马
马俊才机构 暂无
技术领域 暂无
摘要
本公开提供了菌株基因组测序信息查询方法、装置、电子设备及介质。该方法的一具体实施方式包括:响应于接收到管理员终端发送的文件存储请求,将文件存储请求中的注册用户标识、项目标识、菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件对应存储,响应于接收到用户终端发送的文件查询请求,确定文件查询请求中的注册用户标识和测序项目标识是否满足预设对应关系,响应于确定是,查询与测序项目标识对应的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件并发送至用户终端,以供用户终端呈现或存储所收到的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件。该实施方式实现了管理员终端与用户终端之间菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件的安全传输。
1.一种菌株基因组测序信息查询方法,应用于服务器,包括:响应于接收到管理员终端发送的文件存储请求,将所述文件存储请求中的注册用户标识、项目标识、菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件对应存储,其中,所述文件存储请求是所述管理员终端根据管理员输入的注册用户标识、项目标识、菌株原始测序文件存储路径以及菌株基因组注释文件存储路径生成的;响应于接收到用户终端发送的文件查询请求,确定所述文件查询请求中的注册用户标识和测序项目标识是否满足预设对应关系,其中,根据预先存储的注册用户标识和测序项目标识的对应关系确定注册用户标识和测序项目标识是否满足预设对应关系,其中,所述文件查询请求是所述用户终端响应于检测到用户触发的文件查询操作,根据所述文件查询操作所针对的注册用户标识和测序项目标识而生成的;响应于确定是,查询与所述测序项目标识对应的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件并发送至所述用户终端,以供所述用户终端呈现或存储所收到的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件。
2.根据权利要求1所述的方法,其中,所述方法还包括:响应于接收到所述管理员终端发送的项目标识生成请求,生成与所述项目标识生成请求对应的项目标识,并将所生成的项目标识与所述项目标识生成请求中的注册用户标识和物流信息对应存储,其中,所述项目标识生成请求是所述管理员终端响应于检测到管理员触发的项目标识生成操作,根据所述项目标识生成操作所针对的注册用户标识、对应的物流信息而生成的。
3.根据权利要求1所述的方法,其中,所述方法还包括:响应于接收到用户终端发送的物流信息存储请求,将所述物流信息存储请求中的运送待测菌株的物流信息和注册用户标识对应存储,其中,所述物流信息存储请求是所述用户终端响应于检测到用户触发的物流信息存储操作,根据所述物流信息存储操作所针对的注册用户标识和物流信息而生成的;响应于接收到所述管理员终端发送的物流信息查询请求,查询与所述物流信息查询请求中的待查询物流信息对应的注册用户标识,并发送至所述管理员终端,以供所述管理员终端呈现或存储与所述待查询物流信息对应的注册用户标识,其中,所述物流信息查询请求是所述管理员终端响应于接收到管理员输入的待查询物流信息而生成的。
4.根据权利要求1所述的方法,其中,所述方法还包括:响应于接收到所述用户终端发送的送样测序请求,向所述用户终端发送待填写的待测菌株信息;响应于接收到所述用户终端发送的待测菌株信息审核请求,将所述待测菌株信息审核请求中已填写的待测菌株信息和注册用户标识对应存储,确定所述已填写的待测菌株信息是否完整,其中,所述待测菌株信息审核请求是所述用户终端响应于检测到用户触发的待测菌株信息审核操作,根据所述待测菌株信息审核操作所针对的已填写的待测菌株信息和注册用户标识而生成的;响应于确定完整,向所述用户终端发送用于指示待测菌株信息审核通过的提示信息,以供所述用户终端呈现或存储所收到的提示信息;响应于接收到所述用户终端发送的送样测序协议文件上传请求,将所述送样测序协议文件上传请求中的已签订送样测序协议文件和注册用户标识对应存储。
5.一种菌株基因组测序信息查询装置,应用于服务器,包括:文件存储单元,被配置为响应于接收到管理员终端发送的文件存储请求,将所述文件存储请求中的注册用户标识、项目标识、菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件对应存储,其中,所述文件存储请求是所述管理员终端根据管理员输入的注册用户标识、项目标识、菌株原始测序文件存储路径以及菌株基因组注释文件存储路径生成的;确定单元,被配置为响应于接收到用户终端发送的文件查询请求,确定所述文件查询请求中的注册用户标识和测序项目标识是否满足预设对应关系,其中,根据预先存储的注册用户标识和测序项目标识的对应关系确定注册用户标识和测序项目标识是否满足预设对应关系,其中,所述文件查询请求是所述用户终端响应于检测到用户触发的文件查询操作,根据所述文件查询操作所针对的注册用户标识和测序项目标识而生成的;第一查询单元,被配置为转响应于确定是,查询与所述测序项目标识对应的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件并发送至所述用户终端,以供所述用户终端呈现或存储所收到的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件。
6.一种菌株基因组测序信息存储方法,应用于管理员终端,包括:响应于检测到文件存储操作,获取所述文件存储操作所针对的注册用户标识、项目标识、菌株原始测序文件存储路径以及菌株基因组注释文件存储路径,根据所述菌株原始测序文件存储路径以及所述菌株基因组注释文件存储路径获取对应的菌株原始测序文件和菌株基因组注释文件,用所获取的注册用户标识、项目标识、所述菌株原始测序文件和所述菌株基因组注释文件生成文件存储请求;向服务器发送所述文件存储请求,所述文件存储请求用于触发所述服务器将所述文件存储请求中的注册用户标识、项目标识、菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件对应存储,以及响应于接收到用户终端发送的查询请求,确定所述查询请求中的注册用户标识与测序项目标识是否满足预设对应关系,其中,根据预先存储的注册用户标识和测序项目标识的对应关系确定注册用户标识和测序项目标识是否满足预设对应关系,所述查询请求用于触发所述服务器响应于确定是,查询与所述测序项目标识对应的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件并发送至所述用户终端,所述菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件用于触发所述用户终端呈现或存储所收到的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件。
7.根据权利要求6所述的方法,其中,所述方法还包括:响应于检测到管理员触发的项目标识生成操作,根据所述项目标识生成操作所针对的注册用户标识、对应的物流信息生成项目标识生成请求;向所述服务器发送所述项目标识生成请求,所述项目标识生成请求用于触发所述服务器生成与所述项目标识生成请求对应的项目标识,并将生成的项目标识与所述项目标识生成请求中的注册用户标识和物流信息对应存储。
8.根据权利要求6所述的方法,其中,所述方法还包括:根据管理员输入的待查询物流信息生成待查询物流信息查询请求;向所述服务器发送所述待查询物流信息查询请求;响应于接收到所述服务器发送的与所述待查询物流信息对应的注册用户标识,呈现所收到的注册用户标识,其中,所收到的注册用户标识是所述服务器查询到的与所述物流信息查询请求中的待查询物流信息对应的注册用户标识。
9.一种菌株基因组测序信息存储装置,应用于管理员终端,包括:第一生成单元,被配置为响应于检测到文件存储操作,获取所述文件存储操作所针对的注册用户标识、项目标识、菌株原始测序文件存储路径以及菌株基因组注释文件存储路径,根据所述菌株原始测序文件存储路径以及所述菌株基因组注释文件存储路径获取对应的菌株原始测序文件和菌株基因组注释文件,用所获取的注册用户标识、项目标识、所述菌株原始测序文件和所述菌株基因组注释文件生成文件存储请求;第一发送单元,被配置为向服务器发送所述文件存储请求,所述文件存储请求用于触发所述服务器将所述文件存储请求中的注册用户标识、项目标识、菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件对应存储,以及响应于接收到用户终端发送的查询请求,确定所述查询请求中的注册用户标识与测序项目标识是否满足预设对应关系,其中,根据预先存储的注册用户标识和测序项目标识的对应关系确定注册用户标识和测序项目标识是否满足预设对应关系,所述查询请求用于触发所述服务器响应于确定是,查询与所述测序项目标识对应的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件并发送至所述用户终端,所述菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件用于触发所述用户终端呈现或存储所收到的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件。
10.一种菌株基因组测序信息呈现方法,应用于用户终端,包括:响应于检测到用户触发的文件查询操作,根据所述文件查询操作所针对的注册用户标识和测序项目标识,生成文件查询请求;向服务器发送所述文件查询请求;响应于接收到所述服务器发送的与所述测序项目标识对应的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件,呈现或存储所收到的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件,其中,所收到的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件为所述服务器响应于接收到用户终端所述文件查询请求以及确定所述文件查询请求中的注册用户标识与测序项目标识满足预设对应关系而查询到的与所述测序项目标识对应的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件,其中,服务器根据预先存储的注册用户标识和测序项目标识的对应关系确定注册用户标识和测序项目标识是否满足预设对应关系,所述服务器中对应存储的注册用户标识、项目标识、菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件是根据从管理员终端响应于文件存储操作而发送给所述服务器的文件存储请求中的注册用户标识、项目标识、菌株原始测序文件和菌株基因组注释文件而存储的。
11.根据权利要求10所述的方法,其中,所述方法还包括:响应于检测到用户触发的物流信息存储操作,根据所述物流信息存储操作所针对的注册用户标识和物流信息生成的物流信息存储请求;向所述服务器发送所述物流信息存储请求,所述物流信息存储请求用于触发所述服务器将所述物流信息存储请求中的运送待测菌株的物流信息的物流信息和请求对待测菌株进行基因组测序的用户的注册用户标识对应存储。
12.根据权利要求10所述的方法,其中,所述方法还包括:响应于检测到用户触发的送样测序协议文件上传操作,根据所述送样测序协议文件上传操作所针对的注册用户标识和已签订送样测序协议文件生成送样测序协议文件上传请求,以及向所述服务器发送所生成的送样测序协议文件上传请求;接收并呈现所述服务器发送的待填写的待测菌株信息;响应于检测到用户触发的待测菌株信息审核操作,根据所述待测菌株信息审核操作所针对的已填写的待测菌株信息和注册用户标识生成待测菌株信息审核请求;向所述服务器发送所述待测菌株信息审核请求,其中,所述待测菌株信息审核请求用于触发所述服务器将所述待测菌株信息审核请求中已填写的待测菌株信息和注册用户标识对应存储,以及确定所述已填写的待测菌株信息是否完整;响应于接收到所述服务器发送的用于指示待测菌株信息审核通过的提示信息,呈现或存储所收到的提示信息,其中,所收到的提示信息是所述服务器响应于确定所述已填写的待测菌株信息完整而发送的。
13.一种菌株基因组测序信息呈现装置,应用于用户终端,包括:第二生成单元,被配置为响应于检测到用户触发的文件查询操作,根据所述文件查询操作所针对的注册用户标识和测序项目标识,生成文件查询请求;第二发送单元,被配置为向服务器发送所述文件查询请求;呈现单元,被配置为响应于接收到所述服务器发送的与所述测序项目标识对应的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件,呈现或存储所收到的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件,其中,所收到的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件为所述服务器响应于接收到用户终端所述文件查询请求以及确定所述文件查询请求中的注册用户标识与测序项目标识满足预设对应关系而查询到的与所述测序项目标识对应的菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件,其中,服务器根据预先存储的注册用户标识和测序项目标识的对应关系确定注册用户标识和测序项目标识是否满足预设对应关系,所述服务器中对应存储的注册用户标识、项目标识、菌株原始测序文件以及菌株基因组注释文件是根据从管理员终端响应于文件存储操作而发送给所述服务器的文件存储请求中的注册用户标识、项目标识、菌株原始测序文件和菌株基因组注释文件而存储的。
14.一种服务器,包括:一个或多个处理器;存储装置,其上存储有一个或多个程序;当所述一个或多个程序被所述一个或多个处理器执行时,使得所述一个或多个处理器实现如权利要求1-4中任一所述的菌株基因组测序信息查询方法。
15.一种管理员终端,包括:一个或多个处理器;存储装置,其上存储有一个或多个程序;当所述一个或多个程序被所述一个或多个处理器执行时,使得所述一个或多个处理器实现如权利要求6-8中任一所述的菌株基因组测序信息存储方法。
16.一种用户终端,包括:一个或多个处理器;存储装置,其上存储有一个或多个程序;当所述一个或多个程序被所述一个或多个处理器执行时,使得所述一个或多个处理器实现如权利要求10-12中任一所述的菌株基因组测序信息呈现方法。
17.一种计算机可读存储介质,其上存储有计算机程序,其中,所述计算机程序被一个或多个处理器执行时实现如权利要求1-4中任一所述的菌株基因组测序信息查询方法,或者如权利要求6-8中任一所述的菌株基因组测序信息存储方法,或者如权利要求10-12中任一所述的菌株基因组测序信息呈现方法。
18.一种菌株基因组测序信息处理系统,包括如权利要求14所述的服务器、至少一个如权利要求15所述的管理员终端以及至少一个如权利要求16所述的用户终端。



