有效
物种科学名称确定方法、装置、电子设备及存储介质
范国梅、孙清岚、史文聿、吴林寰、马俊才
中国科学院微生物研究所
范
范国梅机构 暂无
技术领域 暂无
孙
孙清岚机构 暂无
技术领域 暂无
史
史文聿机构 暂无
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吴
吴林寰机构 暂无
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马
马俊才机构 暂无
技术领域 暂无
摘要
本公开提供了物种科学名称确定方法、装置、电子设备及存储介质。该方法的一具体实施方式包括:获取目标物种的待确定名称以及对应的菌株编号集合,基于待确定名称,在物种分类数据库中查找与待确定名称匹配的第一物种信息,响应于未查找到与待确定名称匹配的第一物种信息,基于菌株编号集合,从至少两个微生物保藏记录数据库中查找目标物种的其他名称集合,响应于查找到目标物种的其他名称集合,基于其他名称集合,在物种分类数据库中查找与目标物种对应的第二物种信息,以及将第二物种信息中的科学名称和分类号分别确定为目标物种的科学名称和分类号。该实施方式提高了物种科学名称的查全率。
1.一种物种科学名称确定方法,包括:获取目标物种的待确定名称以及对应的菌株编号集合;基于所述待确定名称,在物种分类数据库中查找与所述待确定名称匹配的第一物种信息,以及将所述第一物种信息中的科学名称和分类号分别确定为所述目标物种的科学名称和分类号,其中,所述物种分类数据库用于存储物种信息,物种信息包括科学名称和分类号;响应于未查找到与所述待确定名称匹配的第一物种信息,基于所述菌株编号集合,从至少两个微生物保藏记录数据库中查找所述目标物种的其他名称集合,其中,所述微生物保藏记录数据库用于存储菌株信息,菌株信息包括菌株编号和菌株所属物种的名称;响应于在所述至少两个微生物保藏记录数据库中未查找到所述目标物种的其他名称集合,在所述物种分类数据库中查找物种信息与所述待确定名称之间相似度最高且大于预设相似度阈值的推荐物种信息,以及将所述推荐物种信息中的科学名称和分类号分别确定为所述目标物种的科学名称和分类号;响应于查找到所述目标物种的其他名称集合,基于所述其他名称集合,在所述物种分类数据库中查找与所述目标物种对应的第二物种信息,以及将所述第二物种信息中的科学名称和分类号分别确定为所述目标物种的科学名称和分类号;响应于在所述物种分类数据库中未查找到与所述目标物种对应的第二物种信息,在所述物种分类数据库中查找物种信息与所述待确定名称之间相似度最高且大于预设相似度阈值的推荐物种信息,以及将所述推荐物种信息中的科学名称和分类号分别确定为所述目标物种的科学名称和分类号。
2.根据权利要求1所述的方法,其中,所述物种信息还包括非科学名称,非科学名称包括曾用名和俗名;以及所述基于所述待确定名称,在物种分类数据库中查找与所述待确定名称匹配的第一物种信息,包括:在所述物种分类数据库中查找科学名称与所述待确定名称一致的第一物种信息;响应于未查找到科学名称与所述待确定名称一致的第一物种信息,在所述物种分类数据库中查找非科学名称与所述待确定名称一致的第一物种信息。
3.根据权利要求2所述的方法,其中,所述基于所述菌株编号集合,从至少两个微生物保藏记录数据库中查找所述目标物种的其他名称集合,包括:从所述至少两个微生物保藏记录数据库中选取微生物保藏记录数据库,作为目标微生物保藏记录数据库;对所述目标微生物保藏记录数据库执行以下其他名称集合确定操作:基于所述菌株编号集合,从所述目标微生物保藏记录数据库中查找所述目标物种的其他名称集合,其中,所述至少两个微生物保藏记录数据库包括标准微生物菌种数据库、全球微生物资源目录以及保藏中心资源目录;响应于未查找到所述目标物种的其他名称集合,从所述至少两个微生物保藏记录数据库中未选取过的微生物保藏记录数据库中选取微生物保藏记录数据库,作为所述目标微生物保藏记录数据库,继续执行所述其他名称集合确定操作。
4.根据权利要求1-3中任一项所述的方法,其中,所述基于所述其他名称集合,在所述物种分类数据库中查找与所述目标物种对应的第二物种信息,包括:从所述其他名称集合中选取其他名称,作为目标其他名称;对所述目标其他名称执行以下第二物种信息确定操作:在所述物种分类数据库中查找科学名称与所述目标其他名称一致的第二物种信息;响应于未查找到科学名称与所述目标其他名称一致的第二物种信息,在所述物种分类数据库中查找非科学名称与所述目标其他名称一致的第二物种信息;响应于未查找到非科学名称与所述目标其他名称一致的第二物种信息,从所述其他名称集合中未选取过的其他名称中选取其他名称,作为所述目标其他名称,继续执行所述第二物种信息确定操作。
5.一种物种科学名称确定装置,包括:获取单元,被配置成获取目标物种的待确定名称以及对应的菌株编号集合;第一查找单元,被配置成基于所述待确定名称,在物种分类数据库中查找与所述待确定名称匹配的第一物种信息,以及将所述第一物种信息中的科学名称和分类号分别确定为所述目标物种的科学名称和分类号,其中,所述物种分类数据库用于存储物种信息,物种信息包括科学名称和分类号;第二查找单元,被配置成响应于未查找到与所述待确定名称匹配的第一物种信息,基于所述菌株编号集合,从至少两个微生物保藏记录数据库中查找所述目标物种的其他名称集合,其中,所述微生物保藏记录数据库用于存储菌株信息,菌株信息包括菌株编号和菌株所属物种的名称;第三查找单元,被配置成响应于查找到所述目标物种的其他名称集合,基于所述其他名称集合,在所述物种分类数据库中查找与所述目标物种对应的第二物种信息,以及将所述第二物种信息中的科学名称和分类号分别确定为所述目标物种的科学名称和分类号;第四查找单元,被配置成响应于在所述至少两个微生物保藏记录数据库中未查找到所述目标物种的其他名称集合,在所述物种分类数据库中查找物种信息与所述待确定名称之间相似度最高且大于预设相似度阈值的推荐物种信息,以及将所述推荐物种信息中的科学名称和分类号分别确定为所述目标物种的科学名称和分类号;第五查找单元,被配置成响应于基于所述其他名称集合,在所述物种分类数据库中未查找到与所述目标物种对应的第二物种信息,在所述物种分类数据库中查找物种信息与所述待确定名称之间相似度最高且大于预设相似度阈值的推荐物种信息,以及将所述推荐物种信息中的科学名称和分类号分别确定为所述目标物种的科学名称和分类号。
6.根据权利要求5所述的装置,其中,所述物种信息还包括非科学名称,非科学名称包括曾用名和俗名;以及所述第一查找单元,进一步被配置成:在所述物种分类数据库中查找科学名称与所述待确定名称一致的第一物种信息;响应于未查找到科学名称与所述待确定名称一致的第一物种信息,在所述物种分类数据库中查找非科学名称与所述待确定名称一致的第一物种信息。
7.根据权利要求6所述的装置,其中,所述第二查找单元,进一步被配置成:从所述至少两个微生物保藏记录数据库中选取微生物保藏记录数据库,作为目标微生物保藏记录数据库;对所述目标微生物保藏记录数据库执行以下其他名称集合确定操作:基于所述菌株编号集合,从所述目标微生物保藏记录数据库中查找所述目标物种的其他名称集合,其中,所述至少两个微生物保藏记录数据库包括标准微生物菌种数据库、全球微生物资源目录以及保藏中心资源目录;响应于未查找到所述目标物种的其他名称集合,从所述至少两个微生物保藏记录数据库中未选取过的微生物保藏记录数据库中选取微生物保藏记录数据库,作为所述目标微生物保藏记录数据库,继续执行所述其他名称集合确定操作。
8.根据权利要求5-7中任一项所述的装置,其中,所述第三查找单元,进一步被配置成:从所述其他名称集合中选取其他名称,作为目标其他名称;对所述目标其他名称执行以下第二物种信息确定操作:在所述物种分类数据库中查找科学名称与所述目标其他名称一致的第二物种信息;响应于未查找到科学名称与所述目标其他名称一致的第二物种信息,在所述物种分类数据库中查找非科学名称与所述目标其他名称一致的第二物种信息;响应于未查找到非科学名称与所述目标其他名称一致的第二物种信息,从所述其他名称集合中未选取过的其他名称中选取其他名称,作为所述目标其他名称,继续执行所述第二物种信息确定操作。
9.一种电子设备,包括:一个或多个处理器;存储装置,用于存储一个或多个程序;当所述一个或多个程序被所述一个或多个处理器执行时,使得所述一个或多个处理器实现如权利要求1-4中任一所述的方法。
10.一种计算机可读介质,其上存储有计算机程序,其中,所述程序被处理器执行时实现如权利要求1-4中任一所述的方法。



