高均一性单细胞全基因组扩增

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生物医药
医药健康
基因工程
技术领域:生物医药
榜单金额:20 万
合作方式:技术服务
发布日期:20241201
截止日期:-
需求发布单位: 上海阅尔基因技术有限公司
关键词: 胚胎移植  PGT-A检测  PGT-SR检测  单细胞  全基因扩增  多重PCR  提高均一性 

需求的背景和应用场景

在全国范围内,每年约有5-10万个胚胎需要进行胚胎移植前的PGT-A(Preimplantation Genetic Testing for Aneuploidy,胚胎移植前非整倍体检测)和PGT-SR(Preimplantation Genetic Testing for Structural Rearrangements,胚胎移植前结构重排检测)相关检测。这一市场需求巨大,每个胚胎的检测费用高达3000-5000元。然而,当前技术在实际应用中仍面临诸多挑战,尤其是在单细胞级别的体系构建上。人单个细胞的DNA量极其微量,仅约6pg,因此单细胞全基因扩增成为必要步骤。但扩增后的产物在拷贝数层面往往出现不均一性,这对PGT-A检测的准确性构成了显著困扰。此外,现有PGT-A技术多采用多重PCR建库,基因组覆盖率低(小于10%),变异系数大(CV>3.0),且多基于microarray芯片平台,临床普及率和国产率均不理想。因此,迫切需要开发一种新技术,以提高胚胎移植前PGT-A检测的均一性和准确性,满足临床需求。

要解决的关键技术问题

本技术需求旨在解决以下关键技术问题:

  1. 单细胞全基因扩增的均一性:研发新的扩增方法或优化现有技术,确保在单细胞水平上进行全基因扩增时,扩增产物在拷贝数层面保持高度均一性,以解决当前扩增技术导致的拷贝数不均问题。
  2. 提高基因组覆盖率:通过改进扩增和检测流程,实现全基因组覆盖率的大幅提升,目标覆盖率需达到75%以上,以更全面地评估胚胎的遗传状态。
  3. 降低变异系数(CV):优化检测流程,将变异系数控制在2.0以下,提高检测结果的准确性和可靠性。
  4. 临床普及率与国产率提升:开发基于新技术平台的检测流程,需考虑临床应用的便捷性和成本效益,以促进技术的临床普及,并推动国产化进程。

效果要求

本技术需求期望实现以下效果:

  1. 技术效果:成功研发出高均一性单细胞全基因组扩增技术,显著提高PGT-A检测的准确性和可靠性,为胚胎移植前的遗传筛查提供有力支持。
  2. 经济效益:通过优化检测流程和降低成本,使新技术在保持高准确性的同时,具有更强的市场竞争力,为相关医疗机构和患者带来经济实惠。
  3. 创新优势:新技术应具备显著的创新性,包括但不限于扩增方法、检测流程、数据分析等方面的突破,以形成独特的技术壁垒和竞争优势。
  4. 临床普及与国产化:新技术需考虑临床应用的便捷性和成本效益,以促进其在临床上的广泛应用,并推动相关设备和试剂的国产化进程,提高我国生物医药产业的自主创新能力。

据不完全估计,全国每年约有5-10万个胚胎需要进行胚胎移植前PGT-A和PGT-SR相关检测,每个胚胎检测费用约3000-5000元,市场巨大。当前的技术效果以及成本都存在改进空间。难点在于单细胞级别的体系构建,人单个细胞大概只有6pg左右的DNA,极其微量,普遍做法都需要进行单细胞的全基因的扩增,但是扩增之后的产物在拷贝数层面会变得很不均匀,对PGT-A造成困扰;当前PGT-A多采用多重PCR建库,基因组覆盖率小于10%,CV>3.0,多数是基于microarray芯片平台,临床普及率较差,国产率较低。提高胚胎移植前PGT-A检测的均一性,要求全基因组覆盖在75%以上,CV<2.0,目的在于研发适合于临床需求的检测流程。

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