山东农业大学联合多家机构发布小麦大数据在线平台

从茫茫大数据中快速寻找到目标信息，一键获取小麦单基因的多组学数据，应用于小麦基因鉴定、基因表达分析、分子网络搭建、调控元件分析、优异单倍型鉴定等研究，显著提升功能基因组学研究效率，目前这已成为可能。

日前，山东农业大学联合中科院南京土壤研究所、南京农业大学、西北农林科技大学以及中国农业大学等多家科研院所，发布了国内首个小麦大数据在线平台“小麦组学”（Wheat Omics）。10月27日，该成果论文在植物科学领域知名期刊《分子植物》（Molecular Plant）杂志在线发表。

WheatOmics正式在线发表

本研究中，科研人员以植物氮素吸收的关键基因——NRT2.1为例，研究者利用小麦组学大数据平台提供的同源基因和保守蛋白检索工具，发现NRT2.1基因在小麦A、B和D亚基因组中均存在3个串联重复拷贝区域，为研究该基因（家族）的功能提供了重要基础；利用共线性分析工具，发现该基因（家族）在小麦中出现了明显扩张，为理解其进化机制提供线索；利用基因表达检测工具，发现不同拷贝区域基因的表达存在明显差异，其中串联重复拷贝区域I的基因表达明显与氮信号有关。同时，研究人员进一步利用调控元件和表观组数据分析工具，发现不同串联重复拷贝区域存在不同的序列结构和表观修饰，表明这可能是造成基因差异表达的直接原因。以此说明，研究者利用平台开发的多个功能模块，可快速有效获取目标基因的各种信息，成为目标基因功能研究的便利工具。

WheatOmics数据和工具总览

据论文通讯作者、山东农业大学农学院倪飞副教授介绍，随着小麦多组学数据的大量释放和小麦组学等在线工具的建立，小麦功能基因组学研究已进入了后基因组大数据时代。该平台以小麦功能基因组学研究为切入点，整合并可视化了48套麦族物种基因组、2000多种小麦变异组、3套小麦突变体库外显子组、500余份小麦转录组以及多套小麦表观修饰组等组学大数据，并在此基础上开发了基因鉴定、基因表达/共表达分析、基因功能分析、互作蛋白鉴定以及表观组学分析等功能模块，为小麦功能基因组研究提供了便利工具，解决了国内外小麦研究者不能快速、有效获取目标基因和数据的难题。

WheatOmics助力小麦功能基因组学研究

 研究人员向记者介绍，近年来，不同小麦材料的变异组、转录组、表观组和蛋白组数据呈现出爆发性增长趋势，为小麦功能基因组学的发展带来了新的契机，也是构建平台的初衷。

据了解，“小麦组学”大数据平台是一个免费、易用的在线平台，不仅可以帮助小麦研究者快速有效获取目标基因的可视化多组学数据，而且还提供了多个独特而实用的工具包，为国内外小麦功能基因组学研究提供助力。

截至目前，该平台访问量已累积超过30万次，目前月平均访问量达2万次，并同时被发表在《Nature Genetics》《Nature Communications》等期刊上的超过100篇文章以网站链接的形式引用。

WheatOmics访问量突破30万

山东农业大学农学院倪飞副教授、中科院南京土壤研究所王萌副研究员为该论文的通讯作者，马省伟博士为第一作者。