💡这项突破是什么?
研究结果以Deep genome skimming reveals the hybrid origin of Pseudosasa gracilis (Poaceae: Bambusoideae)为题发表在Plant Diversity上,中国科学院昆明植物研究所已毕业硕士研究生胡湘洲、郭岑博士(现中国科学院西双版纳热带植物园)为论文共同第一作者,郭振华研究员和李德铢研究员为文章共同通讯作者。该研究得到了中国科学院B类先导科技专项(XDB31000000),以及国家自然科学基金项目(32200193)的资助。

图1. 纤细茶秆竹与长舌茶秆竹、多毛华赤竹、华赤竹的主要形态特征对比图
从上至下:(1)植株形态:纤细茶秆竹矮小纤细,叶片呈披针形;长舌茶秆竹高达3 m,叶片呈长椭圆形;多毛华赤竹和华赤竹的叶片也呈披针形,但较纤细茶秆竹叶片面积明显更大。(2)分枝:纤细茶秆竹每节2/3分枝;长舌茶秆竹秆下部每节仅具1分枝,中上部则每节3分枝,无2分枝;多毛华赤竹和华赤竹是典型的1分枝,无2/3分枝。(3)秆环:纤细茶秆竹秆环平,节间光滑,节下具短毛;长舌茶秆竹的秆环稍隆起,节间光滑,节下具白粉;多毛华赤竹和华赤竹的秆环明显隆起,节间具毛且节下具明显的毛环。(4)叶舌/䍁毛:纤细茶秆竹叶舌不明显,但具有明显的数条䍁毛;长舌茶秆竹具有较明显的叶舌,无䍁毛;多毛华赤竹和华赤竹具有非常发达的叶舌。

图2. 纤细茶秆竹系统位置的确定
a. 基于IQ-TREE方法构建的纤细茶秆竹的叶绿体全基因组系统发育树。b. 基于SNPs变异位点构建的NJ树。c. 通过串联法构建的411个“完美拷贝”核基因系统发育树(左、右分别为基于C、D亚基因组基因拷贝构建的系统发育树结果)。

图3. 基因树之间、基因树与假定物种树间的冲突所蕴含的杂交事件
a. 基于来自C(左)和D(右)亚基因组的411个“完美拷贝”核基因构建的溯祖系统发育树,分支节点上的饼图统计了基因树与假定物种树的一致/冲突基因数量信息,红色表示与假定物种树相冲突的基因树,蓝色代表与假定物种树一致的基因树。b. 基于C亚基因组基因拷贝的杂交事件检测。c. 基于D亚基因组基因拷贝的杂交事件检测。d. 不完全谱系分选水平的评估。



