💡这项突破是什么?
2022年7月13日，南京大学生命科学学院、医药生物技术国家重点实验室陈迪俊/孙洋团队联合浙江大学医学院附属儿童医院谢诒诚团队在Nature Communications在线发表题为A reference single-cell regulomic and transcriptomic map of cynomolgus monkeys的研究论文，该研究利用单细胞测序技术绘制了非人灵长类动物食蟹猴（Macaca fascicularis）主要器官的单细胞转录组和调控组参考图谱。基于该图谱，研究者系统比较了不同器官的细胞分化轨迹和细胞互作模式，描绘其相关分子特征；鉴定了大量的器官和细胞特异性顺式调控元件，构建了器官特异性基因调控网络；此外，通过跨物种比较分析，研究者发现食蟹猴与人类在免疫相关的基因表达模式和细胞通讯方面具有极高的相似性，为食蟹猴用于免疫相关疾病模型的研究提供了理论依据。
陈迪俊团队还提供了一个基于scRNA-seq数据探索marker基因表达的交互式网站 (https://biobigdata.nju.edu.cn/MonkeyAtlas/ )。
图3：食蟹猴单细胞转录组基因表达交互式网站截图
后记：在该研究的修稿过程中，由深圳华大生命科学研究院刘龙奇/徐讯/侯勇团队主导的食蟹猴全身多器官单细胞图谱在Nature上发表（论文题目Cell transcriptomic atlas of the non-human primate Macaca fascicularis），绘制了首个非人灵长类动物全细胞图谱，助力人类疾病研究。众所周知，非人灵长类动物在探索人类疾病机制以及药物临床前研究中的重要性愈发凸显，本研究绘制了食蟹猴多器官单细胞转录组和调控组参考图谱，与华大今年4月发表的Nature食蟹猴单细胞图谱文章形成互补，可谓姊妹篇，共同为非人灵长类动物单细胞图谱积累基础性数据，为人类疾病防治及创新药物研发提供助力！
虽然这两项研究在实验设计上具有极高的相似性，但也有一些不同之处。例如，本研究同时涉及转录组和调控组学两方面的信息，因此对同一个器官来说得到的信息更加全面；在数据样本方面，乳腺和肌肉两个器官样本是本研究独有的；在转录组测序方面，本研究采用的是对新鲜组织样本的单细胞RNA测序（scRNA-seq），而华大则是对冷冻组织的单细胞核RNA测序（snRNA-seq），理论上讲scRNA-seq获取的mRNA信息更加全面。总的来说，这两项研究工作具有很好的互补性，为广大科研人员提供了宝贵的非人灵长类动物单细胞数据资源。
南京大学生命科学学院博士生瞿娇、硕士生杨发、博士生祝涛和浙江大学医学院附属儿童医院呼吸科副主任王颖硕为本文共同第一作者，南京大学生命科学学院陈迪俊副教授、孙洋教授和浙江大学医学院附属儿童医院谢诒诚研究员为本文的共同通讯作者。南京大学徐强教授、研究生方雯、丁衍、博士后赵雪，浙江大学陈铭教授、谢强敏教授和旭燃生物齐先佳对该研究亦有贡献。
原文链接：https://doi.org/10.1038/s41467-022-31770-x
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