💡这项突破是什么?
GIST肿瘤突变负荷低,但存在广泛的拷贝数变异,并且随着恶性程度增高,遗传学变异增加。染色体碎裂(chromothripsis)和突变阵雨(kataegis)等复杂遗传学变异富集于原发高危和转移GIST。研究进一步鉴定出新型抑癌基因YLPM1,并证明YLPM1失活通过增强氧化磷酸化促进GIST生长和进展。利用来自同一病人不同转移灶和原发/转移配对肿瘤,证明转移GIST具有复杂的遗传学异质性。最后,作者整合转录组、基因组和拷贝数组数据提出了新的分子分型,四种分子亚型具有不同的基因组、表达谱、免疫学以及临床特性,提出并验证了亚型特异性治疗策略,指出C1亚型单纯手术切除病人即可长期获益,C2亚型(小肠间质瘤)而不是C3亚型(胃间质瘤)有望获益于免疫治疗,C3亚型(免疫荒漠型)适合KIT抑制剂和CDK4/6抑制剂的联合治疗,C4亚型将获益于PDGFRA的分子靶向治疗。
中国科学院上海营养与健康研究所博士毕业生谢飞飞、芦晓晶和刘晓筱,华大基因智惠医学研究院罗淑贞、刘栋兵,上海交通大学附属仁济医院汪明为该论文的共同第一作者,王跃祥、吴逵、曹晖和王思敏为论文的共同通讯作者,该工作还受到上海交通大学附属仁济医院病理科沈艳莹博士、汤道强博士,中国科学院上海营养与健康研究所黄涛研究员、嘉兴第一医院何屹教授和河南科技大学李可博士的支持和帮助。此项成果得到了国家自然科学基金、科技部重点研发计划专项、上海市科委重点项目和国家资助博士后计划的支持,也得到了营养与健康所所级公共技术中心分析测试技术平台、实验动物技术平台的支持。
原文链接:https://www.nature.com/articles/s41467-024-53821-1

图:胃肠间质瘤基因组和转录组图谱,新型分子分型及干预策略



