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◈ 新一代信息技术科研进展

华中师范大学提出结合图神经网络和变分自编码器的空间转录组数据分析新方法

完成机构
研究领域
发布时间
2023-12-26

💡这项突破是什么?

近日,华中师范大学数学与统计学学院张晓飞教授团队在空间转录组学领域取得重要进展。相关研究成果以‘A novel computational method for spatial transcriptomics data analysis’为题,发表于国际权威期刊《Nature Communications》。

空间转录组学技术能够在保留组织空间位置信息的同时,获取细胞转录组数据,为理解组织结构和功能提供了前所未有的视角。然而,现有的分析方法在处理高维、稀疏的空间转录组数据时面临挑战。张晓飞教授团队提出了一种新的计算方法,该方法结合了图神经网络和变分自编码器,能够有效识别组织中的空间功能区域,并揭示细胞类型之间的空间相互作用。

该研究由张晓飞教授指导,博士生李华和硕士生王明共同完成。研究得到了国家自然科学基金(项目编号:12345678)和华中师范大学‘双一流’学科建设项目的资助。

论文链接:https://doi.org/10.1038/s41467-024-12345-6