转录组制备关键技术
随着第二代测序技术的迅猛发展,其高通量、快速、低成本的特点成为越来越多解决生物学问题时的首选,尤其在转录组测序方面更显示出极大的潜力。转录组是指特定生物体在某种状态下所有基因转录产物的总和,转录组研究是功能基因组研究的一项重要内容。转录组是连接基因组遗传信息与生物功能(蛋白质组)的必然纽带,同时相对于真核生物全基因组测序来说,转录组测序得到的序列不含有内含子及其它非编码序列,因此转录组测序有着无可比拟的高性价比优势。测序技术的不断进步,对转录组开展更为深入的测序工作,能够发现更多、更可靠的转录子,然而当前转录组建库仍然面临很多的挑战。
(1)目前的高通量测序技术大都需要较高的样品起始量,对于珍惜样本不友好或低丰度样本文库质量差,测序数据产出低;
(2)同时标准的RNA-Seq技术不能提供序列转录的方向信息,测序后的数据分析不可确定转录本是来源于基因组的正链或负链,不利于统计转录本的数量和确定基因的结构,发现更多的反义转录本。
(3)在文库构建过程中,操作繁琐,建库时间长。所以迫切需要一种可以兼容更低起始投入量、操作简便且同时兼容链特异与非链特异转录组的建库技术。1)廉容低起始投入量(100ng total RNA);2)兼容链特异性与链特异性转录组建库;3)操作作更简便:链特异与非链特异建库只用一个试剂即可区分。二链合成和末端修复(钝化、5'磷酸化、3'加A尾)合并为一步。
金额 80 万
发布日期20241231
2024中国高校科技成果交易会企业技术需求