中国人群全基因组测序与系统分析

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基因工程
医药健康
CGT(细胞与基因治疗)
成果单位: 中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)
合作方式: 面议
所处阶段: 其他
关键词: 全基因组测序分析数据管理高低覆盖度测序策略质控标准数据分析系统研发
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章张
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章张,中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)特聘研究员、国家基因组科学数据中心副主任,主要研究方向为生物大数据整合与信息挖掘,从事或负责生命多组学数据资源体系建设等工作。

所在机构:
中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)

核心问题

中国人群全基因组测序与系统分析成果旨在解决在遗传学研究、疾病预测与诊断、个性化医疗等应用场景中的关键痛点问题。通过大规模的全基因组测序,该成果为揭示中国人群特有的遗传变异、疾病易感性及药物反应差异提供了基础数据支持,填补了国内在该领域大规模基因组数据的空白。

解决方案

该成果采用高低覆盖度相结合的测序策略,高效完成了10万参比人群的全基因组测序。通过建立测序质量控制标准体系,包括样本处理、DNA提取准备、文库构建等环节的严格标准,确保了测序数据的准确性和可靠性。同时,建立了基因组数据分析标准体系,涵盖数据质量控制、预处理、遗传变异分析、基因型推断、遗传图谱构建等标准流程,提高了数据分析的效率和准确性。此外,研发了中国人群基因组测序数据管理系统,实现了大规模基因组数据的规范化管理和高效利用。

竞争优势

该成果在多个方面展现出显著的竞争优势。首先,通过大规模测序和标准化分析流程,提供了丰富且高质量的基因组数据资源,为遗传学研究提供了坚实基础。其次,建立的数据管理系统符合行业标准规范,有效提升了数据管理的效率和安全性。此外,该成果在揭示中国人群遗传特征、疾病易感性及药物反应差异方面具有创新性,为个性化医疗和精准医疗的发展提供了有力支持,具有重要的社会效益和应用价值。

成果公开日期

20221231

所属产业领域

科学研究和技术服务业

成果类型

基础理论

成果体现形式

论文

项目名称

中国人群全基因组测序与系统分析

项目课题来源

国家科技计划

研究形式

独立研究

摘要

采用高低覆盖度相结合的测序策略,完成 10 万参比人群全基因组测序;建立测序质量控制标准体系,包括样本处理、DNA 提取准备、文库构建等测序质量控制标准;建立基因组数据分析标准体系,设计开发测序数据质量控制、数据预处理、遗传变异分析、基因型推断、遗传图谱构建等分析的标准流程规范;研发中国人群基因组测序数据管理系统,建立形成符合行业标准规范的中国人群基因组测序数据管理方法与机制,管理 10 万人基因组测序数据。

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